Methods for tractography-based parcellation of the cortical surface

Tipo de Proyecto: FONDECYT Regular #1190701
Cargo: Investigador Principal
Año adjudicación: 2019. Año Término: 2021.

Descripción

Este proyecto en curso busca continuar con el desarrollo y optimización de herramientas para el estudio y análisis de la conectividad cerebral, utilizando principalmente datos de Resonancia Magnética de Difusión (dMRI), enfocado al estudio del Conectoma Humano.

El estudio del Conectoma Humano ha despertado un gran interés en la comunidad científica desde hace algunos años y ha promovido grandes iniciativas como el Human Connectome Project (http://www.humanconnectomeproject.org/) o el Human Brain Project (https://www.humanbrainproject.eu/).

Su objetivo principal es conocer en más detalle la estructura y funcionamiento del cerebro y lograr construir un diagrama de las regiones cerebrales y sus conexiones. En este análisis convergen una gran cantidad de modalidades, e involucran el estudio de datos anatómicos, funcionales y clínicos, entre otros.

En el caso de este proyecto, los estudios se basan en el estudio de la conectividad, basado principalmente en imágenes de Resonancia Magnética de Alta Resolución Angular (HARDI).

El objetivo principal es proveer a la comunidad de nuevas herramientas que permitan la construcción de conectomas, más representativos de la conectividad anatómica subyacente.

Los desarrollos pretenden:

  • Desarrollar una nueva parcelación cortical híbrida basada en atlas de fibras de materia blanca superficial (SWM) y profunda (DWM).

  • Desarrollar una parcelación cortical basada en clustering de fibras intra- e inter-sujeto.

  • Desarrollar una herramienta interactiva para la visualización, segmentación, y manipulación de fibras de materia blanca (WM).

Memorias de Pregrado relacionadas con el proyecto

Alumno Memoria Fecha de Defensa
Paulo Olivares Memoria de Título Ing. Civil Informática (co-guía): “Implementación GPGPU de método de clustering de fibras cerebrales basado en distribución de puntos” 11 de mayo, 2020.
Isaías Huerta Memoria de Título Ing. Civil Informática (co-guía): “Clustering inter-sujeto de las fibras cerebrales calculadas a partir de tractografía” 29 de enero, 2020.
Felipe Silva V. Memoria de Título Ing. Civil Biomédica: “Método de parcelación cortical basado en una representación mediante grafos de las conexiones cerebrales” 01 de abril, 2019.

Tesis de Postgrado relacionadas con el proyecto

Alumno Tesis Fecha Defensa
Andrea Vásquez V. Magister en Ciencias de la Computación.
“Método eficiente de clustering de fibras cerebrales basado en distribución de puntos”
16 de abril, 2019.

Publicaciones

2007, 2020

Inter-Subject Clustering of Brain Fibers from Whole-Brain Tractography

I. Huerta, A. Vázquez, N. López, J. Houenou, C. Poupon, JF Mangin, P. Guevara, C. Hernández. Inter-Subject Clustering of Brain Fibers from Whole-Brain Tractography. Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society (EMBC’20), Montréal, Canadá, 2020, pp. 1687–1691, 9175342. DOI: https://doi.org/10.1109/EMBC44109.2020.9175342

2007, 2020

GeoSP: A Parallel Method for a Cortical Surface Parcellation Based on Geodesic Distance

N. López, A. Vázquez, C. Poupon, JF Mangin, S. Ladra, P. Guevara. GeoSP: A Parallel Method for a Cortical Surface Parcellation Based on Geodesic Distance. Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society (EMBC’20), Montréal, Canadá, 2020-Julio, pp. 1696–1700, 9175779. DOI: https://doi.org/10.1109/embc44109.2020.9175779  

1805, 2020

Alterations in short-range structural connectivity across the psychosis spectrum: findings from the B-SNIP study

E. Ji, L. Perus, A. Grigis, C. Poupon, S. Sarrazin, P. Guevara, M. Guevara, J.-F. Mangin, J. Houenou. Alterations in short-range structural connectivity across the psychosis spectrum: findings from the B-SNIP study. Schizophrenia International Research Society (SIRS) Annual Congress, Florencia, Italia, 2020-Abril, Volume 46, Issue Supplement_1, Page S97. DOI: https://doi.org/10.1093/schbul/sbaa031.226

105, 2020

Short White Matter Tracts Myelinization is Associated With Impaired Social Cognition in Autism Spectrum Disorder: A NODDI and Relaxometry Study

M.-A. d'Albis, S. Sarrazin, J.-F. Mangin, P. Guevara, M. Guevara, Ch. Laidi, J. Boisgontier, R. Delorme, S. Holiga, C. Bouquet, M. Ly-Le Moal, A. Amestoy, I. Scheid, M. Leboyer, C. Poupon, J. Houenou. Short White Matter Tracts Myelinization is Associated With Impaired Social Cognition in Autism Spectrum Disorder: A NODDI and Relaxometry Study. Abstract in Biological Psychiatry, 87:9, S339, 2020. DOI: https://doi.org/10.1016/j.biopsych.2020.02.870

Noticias

Ignacio Osorio Wallace presentó en OHBM 2019 (the Organization for Human Brain Mapping annual meeting)

El 11 de junio del 2019, el Ingeniero Civil Electrónico Ignacio Osorio Wallace participó en OHBM (Organization for Human Brain [...]

2020-08-14T19:57:59-03:00

Share This Story, Choose Your Platform!

Go to Top