Development and optimization of tools for the study of human brain anatomical connectivity using high angular resolution diffusion MRI

Tipo de Proyecto: FONDECYT Iniciación #11121644
Cargo: Investigador Principal
Año adjudicación: 2012. Año Término: 2015.

Descripción

Este proyecto buscó desarrollar y optimizar herramientas para el estudio y análisis de la conectividad cerebral, utilizando datos de Resonancia Magnética de Difusión (dMRI).

Los estudios se basaron en imágenes de Resonancia Magnética de Alta Resolución Angular (HARDI).

Estás, presentan una muy buena calidad, debido al avance de las tecnologías de adquisición, así como a la adquisición en sí misma (de larga duración, dedicada a la investigación) y a los postprocesamientos realizados, que buscan proveer una buena base para el estudio del cerebro humano adulto sano.

Los resultados principales de este proyecto contemplan:

  • El análisis de la reproductibilidad de los fascículos de asociación cortos del cerebro, utilizando herramientas de agrupamiento de datos (clustering) y parcelaciones corticales.

  • La optimización de un algoritmo de segmentación de las fibras cerebrales, logrando tiempos que permiten una segmentación interactiva (Investigador pricipal: Profesor Miguel Figueroa T.)

  • El desarrollo de una herramienta de visualización y manipulación optimizada de los tractos cerebrales.

Otros resultados interesantes son:

  • Desarrollo de una herramienta de visualización optimizada de los tractos para dispositivos Android (iFiber).

  • Creación de un atlas de fascículos cortos cerebrales

  • Desarrollo de algoritmos para comparación de tractos cerebrales, entre sujetos y entre hemisferios.

Memorias de Pregrado relacionadas con el proyecto

Alumno Memoria Fecha de Defensa
Ignacio Osorio W. Memoria de Título Ing. Civil Electrónica: “Software para Visualización y Extracción Interactiva de Fibras Cerebrales” 31 de diciembre, 2015.
Danilo Bonometti B. Memoria de Título Ing. Civil Electrónica: “Visualización de Fibras Cerebrales” 01 de abril, 2015.
Daniel Seguel B. Memoria de Título Ing. Civil Biomédica: “Algoritmo Automático de Segmentación de Fibras Cortas de Asociación del Cerebro Humano” 17 de marzo, 2015.
Claudio Román G. Memoria de Título Ing. Civil Biomédica: “Clustering de Fibras Cerebrales Cortas Calculadas a partir de Imágenes de Resonancia Magnética de Difusión” 16 de enero, 2015.
Miguel Guevara O. Memoria de Título Ing. Civil Biomédica: “Algoritmo de Segmentación Automática de las Fibras Cerebrales Cortas de la Región Fronto-Parietal y la Ínsula” 16 de enero, 2015.
Pablo L. Silva P. Memoria de Título Ing. Civil Biomédica: “Parcelación de la Corteza Cerebral Basado en la Conectividad Anatómica” 29 de mayo, 2014.
Eduardo Venegas A. Memoria de Título Ing. Civil Electrónica: “Desarrollo de un software de manipulación interactiva de fibras cerebrales” 18 de julio, 2014.
Edison Pardo R. Memoria de Título Ing. Civil Electrónica: “Estudio de Variabilidad de las Conexiones Asociación Cortas del Cerebro Humano” 4 de abril, 2013.
Nicole A. Labra A. Memoria de Título Ing. Civil Biomédica: “Optimización de Algoritmo de Clasificación de Fibras de Materia Blanca basada en el Atlas de Fasciculos Cerebrales” 30 de abril, 2013.
Gabriel E. Varela M. Memoria de Título Ing. Civil Biomédica: “Cálculo de Índices del Tensor de Difusión a partir del Algoritmo de Westin” 4 de abril, 2013.

Tesis de Postgrado relacionadas con el proyecto

Alumno Memoria Fecha de Defensa
Claudio Román G. Magister en Ciencias de la Ingeniería c/m en Ing. Eléctrica.
“Segmentación de fibras cerebrales cortas basada en Clustering jerárquico a partir de base de datos HARDI”		 30 de noviembre, 2016.
Miguel Guevara O. Magister en Ciencias de la Ingeniería c/m en Ing. Eléctrica.
“Parcelación de la corteza cerebral basada en atlas de fibras calculadas a partir de tractografía”		 30 de enero, 2016.
Nicole Labra A. Magister en Ciencias de la Ingeniería c/m en Ing. Eléctrica, (co-director)
“Segmentación rápida de fibras de sustancia blanca cerebrales”		 28 de enero, 2015.

Publicaciones

2606, 2016

An interactive software for the visualisation and extraction of tractography datasets

I. Osorio, D. Bonometti, C. Poupon, J-F. Mangin and P. Guevara. An interactive software for the visualisation and extraction of tractography datasets. 22th Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping (OHBM), Ginebra, Suiza, 2016. Temporary link: https://ww5.aievolution.com/hbm1601/index.cfm?do=abs.viewAbs&abs=1412

2810, 2015

iFiber: a Brain Tract Visualizer for Android Devices.

M. Guevara, I. Osorio, D. Bonometti, D. Duclap, C. Poupon, J-F. Mangin and P. Guevara. iFiber: a Brain Tract Visualizer for Android Devices. IEEE Chilecon Conference, Santiago, Chile, 2015. DOI: http://dx.doi.org/10.1109/Chilecon.2015.7400383

2508, 2015

A simple reproducibility evaluation method of short association white matter fiber clustering results for HARDI data.

C. Román, M. Guevara, D. Duclap, A. Lebois, C. Poupon, J.-F. Mangin and P. Guevara. A simple reproducibility evaluation method of short association white matter fiber clustering results for HARDI data. Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society, Milan, Italy, 2015. Temporary link: http://emb.citengine.com/event/embc-2015/paper-details?pdID=6101

2508, 2015

A fast tractography visualization tool using modern OpenGL.

D. Bonometti, I. Osorio, D. Duclap, A. Lebois, C. Poupon, J.-F. Mangin and P. Guevara. A fast tractography visualization tool using modern OpenGL. Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society, Milan, Italy, 2015. Temporary link: http://emb.citengine.com/event/embc-2015/paper-details?pdID=6315

Noticias

2018-11-10T01:11:58-03:00

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